- 段星;王妙辰;王译葵;杨锦;叶润华;周素娟;王继宝;杨涛;杨跃诚;姚仕堂;丁盈盈;何纳;段松;
目的 了解德宏傣族景颇族自治州(德宏州)2017—2019年新报告人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者治疗前HIV耐药突变位点情况及影响耐药发生的相关社会因素，为减少HIV感染者耐药发生，合理抗病毒治疗提供科学依据。方法 采用横断面研究方法，对德宏州2017—2019年新报告HIV感染者血浆样本提取核酸并扩增pol基因片段，确定耐药突变位点。收集HIV感染者的疫情卡片及社会人口学特征，运用构成比、均数和标准差或中位数和四分位间距(interquartile, IQR)等描述研究对象社会人口学特征及实验室指标情况，采用多因素logistic回归分析耐药发生的影响因素。结果 2017—2019年德宏州新报告HIV感染者共3 278例，对首次确证阳性患者样本剩余血浆量≥200μl的2 346例进行耐药检测，有1 796例感染者的样本获得pol基因序列，其中，男性感染者1 216例(67.7%)、异性传播1 414例(78.7%)、中国籍感染者674例(37.5%)。2017—2019年新报告HIV感染者治疗前总体耐药率达7.1%(127/1 796)。多因素logistic回归分析结果显示，在中国籍和缅甸籍HIV感染者中，发生耐药的影响因素有CRF01＿AE亚型(OR=0.28,95%CI:0.08～0.99)、景颇族(OR=8.67,95%CI:1.13～66.39)、傣族(OR=11.99,95%CI:1.56～92.22)以及自愿咨询检测发现的感染者(OR=3.49,95%CI:1.21～10.08)。结论 德宏州2017—2019年新报告HIV感染者治疗前耐药发生率处于中度流行。中国籍感染者CRF01＿AE亚型的发生耐药风险较低，而境内缅甸籍感染者中景颇族和傣族以及自愿咨询检测发现者发生耐药风险较高。
2022年05期 v.12 343-348页 [查看摘要][在线阅读][下载 210K] - 孙咏冰;宋兵;田净;赵壮红;姜天俊;
目的 了解人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者的新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)防治相关认知水平、接种新型冠状病毒疫苗(简称新冠疫苗)的意愿及影响因素，为提高该人群疫苗接种意愿和接种率提供参考依据。方法 采用问卷调查的方法，于2021年6—12月对解放军总医院第五医学中心HIV门诊就诊的169例HIV感染者进行问卷调查，采用描述性分析、单因素分析及二元logistic回归模型分析HIV感染者对新冠肺炎防治认知情况、接种疫苗意愿及影响因素。结果 共169例HIV感染者参与调查，其中93.5%(158/169)的人会主动了解新冠肺炎的相关知识，88.2%(149/169)的人被提醒注射疫苗，98.8%(167/169)的人会远离中高风险地区，97.0%(164/169)的人会劝导他人按照防疫要求做，14.2%(24/169)的人认为宣传有夸大的成分，30.8%(52/169)的人对疫苗本身的安全性存在担心，80.5%(136/169)的人认为打完疫苗会觉得安心，98.2%(166/169)的人认为疫苗是抵抗新冠肺炎的有效方式，HIV感染者接种意愿为60.4%(102/169)。年龄和打完疫苗是否会觉得安心是影响新冠疫苗接种意愿的重要因素。结论 HIV感染者对接种新型冠状病毒疫苗持谨慎态度，疫苗接种率低于一般人群，应加大宣传科普，提高特殊人群的疫苗接种率。
2022年05期 v.12 349-352页 [查看摘要][在线阅读][下载 163K] - 王雪莹;连雪屏;康倩;陈建华;张慧;汪鹏;张慧敏;于德山;
目的 对甘肃省兰州市安宁区某养老院肠胃炎腹泻暴发疫情进行流行病学和病原学分析，为社区养老机构诺如病毒腹泻疫情防控提供科学依据。方法 2021年1月28日—2月4日对兰州市安宁区某养老院所有腹泻暴发病例、护理人员、厨师等进行流行病学调查，采集调查对象肛拭子、粪便、呕吐物等用实时荧光聚合酶链反应(real time fluorescence quantitative PCR)进行诺如病毒检测，选取不同人员阳性标本(Ct值≤25)进行诺如病毒的ORF1/ORF2核苷酸序列测定，使用MEGA-X软件的邻接法构建系统进化树并进行遗传进化分析。结果 本起疫情首发病例发病时间为2021年1月20日，1月25—29日为发病高峰，累计报告有临床诊断病例58例，其中老年人57人，住院老年人罹患率为15.83%(57/360),症状以腹泻(50/58,86.21%)、呕吐(35/58,60.34%)、恶心(13/58,22.41%)和腹痛(6/58,10.34%)为主，均为轻症病人；从厨师、保洁、护理等人员中检出无症状感染者53人。共检测163份标本，诺如病毒GⅡ型阳性率49.08%(80/163),护理人员、厨师、保洁人员等粪便阳性率48.62%(53/109),物表拭子阳性率11.11%(2/18),患者标本检测相继排除了SARS-CoV-2等其他病原感染。选取13份阳性样本进行测序，结果9份(4份老年人肛拭子、4份护理人员粪便样本、1份厨师粪便样本)测序成功，均为重组GⅡ.4 Sydney＿2012[P16],处于独立的一簇，与兰州市2020年GⅡ.10[P16]、2019年GⅡ.2[P16]病毒株处于一个大进化分支，亲缘关系较近。结论 GⅡ.4 Sydney＿2012[P16]基因型毒株是本起暴发疫情的致病病原体。饮食、卫生、护理活动等是引起暴发和感染持续存在的主要因素，应关注诺如病毒无症状感染者在诺如病毒传播中的作用，强化养老院等集中护理疗养场所的公共卫生管理，尤其要预防通过养老院工作人员等携带病毒造成疾病的传播。
2022年05期 v.12 353-357页 [查看摘要][在线阅读][下载 360K] - 李多;曹继东;康家荣;徐闻;刘晓强;
目的 对云南省首例输入性寨卡病毒病病例进行描述性流行病学分析以及实验室检测结果分析，为防控输入性传染病疫情提供参考。方法 对2019年云南省首个输入性寨卡病毒病病例进行流行病学调查与处置，并对病例的血清和尿液标本进行核酸检测；同时对病例标本进行高通量测序，测序结果在CLC Genomics Workbench软件上进行分析拼接，最后利用Mega软件进行病毒基因分子特征分析和系统进化树构建及同源性分析。结果 该病例回国前在缅甸有发热、头痛和眼眶疼痛的症状，入境后核酸检测结果显示寨卡病毒阳性。系统发育树显示该云南寨卡病毒株属亚洲系东南亚流行分支，基因同源性分析表明该寨卡病毒株与东南亚、太平洋和美国寨卡病毒株的同源性在97.3%～99.1%。该寨卡病毒具有139N、982V、2634M的基因分子特征。结论 2019年7月云南省首例输入性寨卡病毒病病例的寨卡病毒株属于亚洲系东南亚分支。该病例于缅甸感染，其流行病学调查结果与实验室诊断结果一致。云南与东南亚接壤，面临着巨大的新发再发传染病输入风险，全省应加强边境传染病监测与检测工作。
2022年05期 v.12 358-363页 [查看摘要][在线阅读][下载 2287K] - 刘艳艳;周永明;赵云珍;颜军;刘如锦;杨春丽;伏晓庆;侯敏;
目的 分析昆明市2018—2021年手足口病病原构成，研究柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CVA4)的流行特点及VP1编码序列系统进化与氨基酸变异情况。方法 采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcript-polymerase chain reaction, real time RT-PCR)对2018—2021年昆明市疾病预防控制中心监测到的昆明市手足口病病例标本3 553份进行肠道病毒核酸检测，描述CVA4的流行情况，并进行VP1编码序列全长测序、氨基酸位点变异及系统进化分析。结果 共检出肠道病毒阳性标本2 531份，阳性率71.24%,其中CVA16、EV-A71及其他肠道病毒(非EV-A71、非CVA16)占阳性样本的构成比分别为38.05%(963/2 531)、4.11%(104/2 531)和57.84%(1 464/2 531)。CVA4阳性52份，其高发区域为昆明市区及东南部，涉及5个县区，阳性数占CVA4病例总数的73.08%(38/52),高发时间为8—12月，占CVA4病例总数的71.15%(37/52),高危人群为1～3岁儿童，占86.54%(45/52),男性多于女性，多引起轻症。CVA4共测序成功51份，核苷酸相似性为90.90%～100.00%,氨基酸相似性为97.30%～100.00%,均为C基因型C2亚型，分为3个传播链(cluster),clusterⅠ以2019年昆明市毒株为主，clusterⅡ以2020和2021年昆明市毒株为主，clusterⅠ、Ⅱ包含了98.04%(50/51)昆明市毒株。与原型株High Point(AF081295)VP1区氨基酸序列相比，有R18K、T23V、A34T、S102A、A200T、I262V、R274K和Y285H共8个高频氨基酸变异位点。结论 2018—2021年昆明市手足口病病原谱中其他肠道病毒(非EV-A71、非CVA16)占主导地位，CVA4作为其中的一个重要类型，属于C2亚型。应针对昆明市主城区及东南部区县、8—12月和1～3岁儿童等因素合理配置防控资源，做好CVA4防控工作。
2022年05期 v.12 364-370页 [查看摘要][在线阅读][下载 1299K] - 曾庆;耿进妹;刘静雯;李魁彪;狄飚;张晓;谢华萍;
目的 了解广州市肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EV-A71)疫苗上市后EV-A71流行强度及VP1区基因特征。方法 采集2016—2019年广州市各区疾病预防控制中心及哨点医院上送的手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例的粪便及肛拭子样本，采用荧光逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)对样本进行总肠道病毒(enterovirus, EV)、柯萨奇病毒A16 (coxsackievirus, CVA16)和EV-A71的核酸检测，挑选EV-A71阳性样本进行病毒分离和VP1区测序。使用DNAstar7.1及MEGA6.0对序列进行分析。结果 2016—2019年共检测到肠道病毒阳性样本10 116份。EV-A71阳性样本占7.32%(740/10 116),其中，2016年占13.79%(332/2 408),2017年占15.62%(376/2 407),2018年占1.30%(31/2 376),2019年占0.03%(1/2 925)。本研究共获得37株EV-A71 VP1区完整序列，均属于C4a亚型。核苷酸相似性为91.5%～100.0%,氨基酸同源性为98.3%～100.0%。与C4a亚型参考株序列核苷酸相似性和氨基酸同源性分别为90.3%～98.4%和97.3%～100.0%;与早期广州市EV-A71核苷酸相似性和氨基酸同源性分别为90.5%～97.9%和97.6%～100.0%。通过对EV-A71 VP1区中和表位及抗原性位点比对，发现1株2017年流行株中和表位VP1-PEP27序列中发生VP1 L150V变异，抗原位点未发生变异。分子进化树显示广州市EV-A71与国内C4a亚型代表株属于同一分支，但形成多个流行簇。结论 在EV-A71疫苗上市后，广州市EV-A71检出率呈逐年降低趋势，C4a为广州市EV-A71流行的唯一基因亚型。应加强对VP1区中和表位及抗原位点的监测。
2022年05期 v.12 371-375页 [查看摘要][在线阅读][下载 581K] - 宫金伶;张秀莲;肖思颖;刘思彤;刘颂;孙睿;汪照国;柴青;
目的 了解7株青岛市CVA4病毒株的全基因组特征，探讨CVA4毒株的基因变异进化特征。方法 对人恶性胚胎横纹肌瘤细胞(human malignant embryonal rhabdomyoma cell, RD cell)培养分离得到的7株来源于青岛市手足口病普通病例的CVA4毒株进行全基因组序列扩增，应用BioEdit7.09、DNASTAR6.0、MEGA5.2和SimPlot序列分析软件对扩增产物进行拼接比对测序，并与从GenBank中选取的5株中国CVA4毒株进行比对。结果 7株青岛CVA4毒株基因组核苷酸数目为7 344～7 395 bp,与原型株AY421762.1HIGH POINT比较，在编码区无碱基插入和缺失。对7株毒株进行两两同源比对，结果显示7株青岛CVA4毒株全基因组序列核苷酸一致性为87.44%～97.79%,氨基酸同源性为97.17%～99.09%。基因重组分析结果显示，15FG936株与A2/P373/2013/China株存在基因重组，15FG1059株与CV-A6/40428/TKM/2011株存在基因重组，其他5株CVA4毒株未发现明显的重组。结论 青岛市7株CVA4毒株中有2株发生了基因重组变异。
2022年05期 v.12 376-380页 [查看摘要][在线阅读][下载 2448K]