- 李伟;张佳珂;林世华;周兴余;冯玉亮;
目的 对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法 通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离，利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus, NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定，同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase, RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase, HEL1)、刺突蛋白(spike protein, S蛋白)基因序列并测序，然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析，利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果 SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变，但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示，2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高，分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明，2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近，处于同一进化分支。结论 SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库，对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。
2022年02期 v.12 108-113页 [查看摘要][在线阅读][下载 979K] - 周雪花;徐敏;姜黎黎;周晓芳;寸建萍;伏晓庆;田炳均;李金松;
目的 对2020年云南省文山州手足口病病例中一株新型星状病毒MLB1型(astrovirus-MLB1,AstV-MLB1)进行分子生物学鉴定。方法 从2020年文山州手足口病实验监测系统采集3岁患儿粪便标本(编号296号),先用MD91/OL68-1引物检测手足口病病原，再用SF0080/SF0094、SF0073/SF0076和SF0061/SF0053引物分别扩增星状病毒开放阅读框(open reading frame, ORF),ORF1a、ORF1b和ORF2片段并进行基因测序，用Sequencher 4.0软件对序列进行编辑后，与GenBank数据库中的序列进行对比，构建进化树，对病毒进行鉴定。结果 基因测序和进化分析表明，296号病例标本在肠道病毒VP4/VP2结合区最接近分离自2020年云南省曲靖市手足口病病例中一株柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)(55/QJ/YN/CHN/2020),它们之间的核苷酸相似性为98.80%,氨基酸同源性为98.40%;与CVA6原型株Gdula(AF081297)的核苷酸相似性为81.91%,氨基酸同源性为94.40%,证明296号病例标本为CVA6病毒。在星状病毒开放读码框ORF1a、ORF1b和ORF2三个片段，标本296号病例与新型AstV-MLB1香港株HK05(基因库ID:HM450380)最接近，核苷酸相似性分别为98.10%、94.30%和97.00%,氨基酸同源性分别为99.50%、97.70%和98.50%。与新型AstV-MLB1原型株(FJ222451)的核苷酸相似性分别为95.70%、94.50%和95.70%,氨基酸同源性分别为98.50%、96.20%和99.50%,证明296号病例标本为新型AstV-MLB1。结论 从手足口病病例中检测到由肠道病毒CVA6与AstV-MLB1混合感染的病例。AstV-MLB1在全球广泛存在，有必要在腹泻病毒监测项目中加强对AstV-MLB1的监测和研究。
2022年02期 v.12 114-118页 [查看摘要][在线阅读][下载 1035K] - 庞灿;崔景茜;李砚萍;李佳;李茜瑶;徐聪慧;卢红艳;李洁;
目的 研究北京市人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)患者关于流感及流感疫苗的知识、态度和行为现况及其影响因素。方法 依托北京市的艾滋病咨询检测门诊和定点治疗机构，采用方便抽样的方法对2021年4月—12月通过首都医科大学附属北京佑安医院和地坛医院的HIV感染者/AIDS患者进行问卷调查。采用χ~2检验、秩和检验和二元logistic回归模型分析HIV感染者/AIDS患者流感相关知识、态度、行为的差异及其影响因素。结果 共回收来自HIV感染者/AIDS患者的问卷525例，其中有效问卷521份(99.24%)。调查对象流感相关知识知晓率72.02%(3 752/5 210),高中或中专及以上文化程度、性取向为同性或异性、当前月收入在10 000～20 000元的调查对象流感相关知识水平更高；正向态度持有率55.09%(1 722/3 126),近3年有其他疫苗接种史、流感相关知识水平较高的人群流感相关态度水平更好；正向行为形成率为66.99%(349/521),近3年有其他疫苗接种史的调查对象具有更好的正向行为水平。调查对象过去1年流感疫苗接种率8.64%。结论 北京市HIV感染者/AIDS患者流感及流感疫苗的知识、态度、行为水平不高，流感疫苗接种率较低。应加强流感相关知识的宣传，尤其是针对文化程度较低、当前月收入较低的群体进行宣传，以提高该人群流感知识、态度、行为情况和流感疫苗接种率。
2022年02期 v.12 119-125页 [查看摘要][在线阅读][下载 882K] - 赵剑虹;韩桃利;张玉松;焦洋;刘丹;高艳;房琼琼;孙灵利;
目的 分析北京市朝阳区2009—2019年甲型H1N1流感病毒(H1N1)血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征，了解朝阳区H1N1变异情况，为评估流感疫苗有效性提供依据。方法 从GenBank数据库和GISAID平台下载2009—2019年流感疫苗推荐株以及各分支主要流行株和代表株序列，与北京市朝阳区46株H1N1北京分离株的HA基因序列进行系统进化分析和氨基酸变异分析。利用MEGA 5.0软件邻接法(neighbor-joining, NJ)构建系统进化树并查看氨基酸变异位点，同时采用NetNGlyc 1.0在线软件分析HA基因潜在的糖基化位点。结果 北京市朝阳区46株H1N1分离株HA基因分别属于Clade 7、Clade 8、6B、6B.1、6B.2及6C等分支。除2009年以外，2012—2019年H1N1北京市朝阳区分离株与对应年度疫苗株比较接近，同源性为90%以上。各年份H1N1北京市朝阳区分离株在4个抗原决定簇区均有氨基酸变异发生，近年H1N1北京市朝阳区分离株所在的6B.1分支序列均有S74R(Cb区)、S164T(Sa区)共同氨基酸变异；除了6B.1A2分支，其余6B.1分支序列均增加1个糖基化位点162 NQTY,其中6B.1新分支同时在162位点(Sa区)上发生氨基酸共同变异导致其糖基化位点162 NQTY转变为162 NQSY;其中，A/Beijing-Chaoyang/SWL465/2019北京市朝阳区分离株的受体结合部位发现氨基酸共同变异位点，分别位于190螺旋的D/V187A位和220环的R223Q位。结论 2009—2019年北京市朝阳区H1N1分离株的HA基因不断发生变异，总体与对应年度疫苗株比较接近，但仍有抗原决定簇和受体结合部位发生氨基酸变异、糖基化位点增加，提示持续监测H1N1的HA基因的必要性，并可为流感疫苗筛选和疫情防控提供参考。
2022年02期 v.12 126-132页 [查看摘要][在线阅读][下载 1084K] - 叶文;欧新华;肖姗;李灵之;裴瑞青;扶会媛;黄政;
目的 了解2014—2019年长沙市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病原谱构成及流行病学特征，为做好手足口病防控工作提供参考依据。方法 2014年1月至2019年12月长沙市手足口病临床诊断病例样本，使用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time polymerase chain reaction, RT-PCR)方法检测标本中的病毒核酸。用Excel 2007软件分析统计结果。结果 2014—2019年共收集样本3 569份，手足口病核酸检测阳性样本2 463份(阳性率69.01%)。进一步分型结果显示柯萨奇病毒(coxsackievirus, CV)A组16型(CVA16)阳性538份(阳性率15.07%),肠道病毒(enterovirus, EV)A组71型(EV-A71)阳性345份(阳性率9.67%),其他型别肠道病毒阳性1 575份(阳性率44.13%),5例病例为CVA16和EV-A71共同感染(阳性率0.14%)。按照病例分类将手足口病样本分为散发轻症、散发重症和聚集性疫情三类，不同病例分类之间的核酸阳性检测结果差异有统计学意义(χ~2=146.36,P<0.01)。2014—2019年长沙市手足口病病例样本阳性率多在4—7月和9—11月达到高峰，CV-A16型全年阳性率呈现出隔年升高的周期性趋势，其中EV-A71型下降明显，其他肠道病毒型别有所增加。对于2019年出现的其他型别肠道病毒阳性率双高峰的情况，RT-PCR结果显示优势病原体为柯萨奇病毒A组6型(CVA6)。结论 2014—2019年长沙市手足口病的主要致病病原体为CVA16和EV-A71,CVA6有逐渐上升的趋势。应在加强病原监测的同时关注病原谱的变化，掌握手足口病病原体的流行规律，从而更加有针对性地做好手足口病防控措施。
2022年02期 v.12 133-137页 [查看摘要][在线阅读][下载 994K]