- 邵冰;邵弘;杜娟;宋波;台志艳;林元龙;迟宗;杨颜泽;王福祥;
目的探讨长链非编码LncRNA和mRNA在人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)转录激活过程中的表达情况。方法从公共数据平台Gene Expression Omnibus(GEO)下载HIV相关LncRNA+mRNA基因芯片数据集GSE74818。对其中感染时间在18h和30h的芯片探针进行重新分析,筛选出HIV从整合到基因组中到转录形成成熟病毒这一过程中差异表达的LncRNA和mRNA。采用R软件Limma包分析LncRNA和mRNA基因表达谱。结果从经过归一化、过滤和去除重复探针后筛选出1 366个差异表达基因,其中LncRNA 297个,mRNA 1 069个。LncRNA中表达上调的有188个,表达下调的有109个。mRNA表达上调的有530个,有539个表达下调。对差异表达的mRNA进行GO基因富集分析发现,在生物学过程中:主要富集在核小体、染色质组装、核小体组织、负性正性基因表达调控、表观遗传、染色质沉默等条目中;在细胞组分过程中:主要富集在核染色质、蛋白-DNA复合物、核小体、DNA包装复合物等条目中;在分子功能过程中:主要富集在蛋白异二聚体激活、核小体DNA结合条目中。KEGG pathway富集分析结果显示:差异表达的mRNA主要富集在系统性红斑狼疮、类固醇生物合成、酒精中毒、病毒致肿瘤、P53信号通路等中。结论 HIV从整合到基因组到形成成熟病毒这一过程中存在LncRNA和mRNA的差异表达,差异表达的RNA主要涉及到基因的转录调控过程和免疫通路调控过程。
2018年05期 v.8 353-358页 [查看摘要][在线阅读][下载 2747K] - 郭娜;姜太一;汪雯;粟斌;吴昊;
目的分析44例艾滋病合并淋巴瘤患者临床特征,探讨其发病特点及转归预后。方法采用回顾性分析方法,对北京佑安医院感染中心2010-2017年收治的44例艾滋病合并淋巴瘤患者流行病学资料、临床症状及体征、辅助检查资料、治疗情况及临床转归等进行分析。结果 44例艾滋病合并淋巴瘤患者中,男性占93.2%(41/44),年龄(39.5±11.7)岁,CD4+T淋巴细胞为(187.8±151.8)个/μl。27例患者诊断为弥漫大B细胞淋巴瘤,5例诊断为伯基特淋巴瘤,1例为经典型霍奇金淋巴瘤,1例NK-T细胞淋巴瘤,1例浆母细胞淋巴瘤,1例小B细胞淋巴瘤,8例患者为B细胞来源非霍奇金淋巴瘤,未进一步进行病理分型。患者多表现为隐匿性起病,且诊断时分期较晚,Ⅲ~Ⅳ期患者占63.6%(28/44)。44例患者中,共有28例患者接受联合治疗。22例患者死亡,20例患者完成6~8程化疗,其中9例患者达到部分缓解,11例患者达到完全缓解。结论 HIV合并淋巴瘤患者临床表现多样,早期诊断和规范的抗病毒治疗联合化疗可以延缓疾病进展,有助于改善患者预后。
2018年05期 v.8 359-363页 [查看摘要][在线阅读][下载 143K] - 冯世艳;邵冰;陈晓红;林元龙;杜娟;宋波;王福祥;
目的调查研究哈尔滨市接受抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒(human immunodeficency virus,HIV)感染者/艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)患者睡眠障碍、焦虑及抑郁(sleep disorder,anxiety,depression,SAD)的发生率、影响因素和相关性。方法采用横断面调查方法,于2017年1月至2017年4月,随机抽取哈尔滨医科大学附属第四医院收治的接受抗病毒治疗的艾滋病患者共309例,通过医院用焦虑抑郁评估量表(anxiety and depression assessment scale,HAD)、匹兹堡睡眠质量指数(Pittsburgh sleep quality index,PSQI)对其进行问卷调查。使用SAS 9.1.3进行资料统计分析。结果完成PSQI问卷的患者中,54.05%(167/309)的患者出现睡眠障碍(PSQI评分>5),其中10.03%(31/309)的患者睡眠质量较差(PSQI评分为11~15),0.65%(2/309)的患者睡眠质量为很差(PSQI评分为16~21);完成HAD问卷的患者中,焦虑发生率为39.48%(122/309),抑郁发生率为32.36%(100/309)。服用兴奋剂、睡眠情况、情绪低落和用药情况对睡眠质量的构成差异有统计学意义(P<0.05),服药情况、睡眠情况、情绪低落对是否焦虑的构成差异有统计学意义(P<0.05),年龄、婚姻状况、教育水平、职业、朋友知情情况、情绪低落对是否抑郁的构成差异有统计学意义(P<0.05)。睡眠障碍、抑郁、焦虑的主效应以及睡眠障碍与抑郁、睡眠障碍与焦虑、抑郁与焦虑的二阶交互作用均有统计学意义。结论哈尔滨市抗病毒治疗HIV感染者/AIDS患者的睡眠障碍、焦虑、抑郁存在相关性,睡眠障碍的患者通常伴有焦虑、抑郁的症状,抑郁的患者通常也伴有焦虑。
2018年05期 v.8 364-369页 [查看摘要][在线阅读][下载 152K] - 王毅;李六林;周万明;樊静;赵西和;唐宇;何静;刘江;周力;张晓军;
目的了解年轻男男性行为者(young men who have sex with men,YMSM)自杀行为现状,分析自杀未遂影响因素。方法在四川省绵阳市以滚雪球抽样法招募15~24周岁男男性行为者作为调查对象并进行血清学检测。单因素分析用χ2检验,多因素分析用非条件logistic回归。结果共调查350人,自杀意念报告率20.0%,自杀未遂报告率6.6%。多因素分析结果表明首次同性性行为被引诱(OR=9.512,95%CI:2.020~44.787)、性角色插入方/均可(OR=5.918,95%CI:1.137~30.308)、因性取向被强迫性行为(OR=24.888,95%CI:2.317~267.329)及抑郁症状(OR=4.187,95%CI:1.043~16.799)是YMSM自杀未遂的危险因素。首次同性性行为年龄≥18岁(OR=0.060,95%CI:0.012~0.305)是保护因素。结论 YMSM自杀行为发生率高于其他人群,首次性经历、强迫性行为、性角色及心理障碍对自杀未遂影响明显,应在该人群中开展自杀危机干预。
2018年05期 v.8 370-374页 [查看摘要][在线阅读][下载 144K]
- 孙妍兰;李伟;吴晶;王怡;
目的探讨西宁市2012-2016年气象因素与流感样病例(influenza-like illness,ILI)的关系。方法收集2012-2016年西宁市ILI监测数据和同期的主要气象因素(气温、相对湿度、气压、风速等),用相关分析和分布滞后非线性模型分析气象因素与ILI发病数的关系。结果西宁市2012-2016年共报告ILI病例19 951例,发病高峰集中在每年的11月份至次年4月份。5年间日平均气温、日最高气温、日最低气温、温差中位数分为7.8℃、16.2℃、1.1℃、15.7℃,日平均相对湿度、平均风速、平均气压中位数分别为58.0%、1.0m/s、770.4hPa。相关分析结果显示,温差、平均气压与日ILI例数之间呈正相关(r=0.126、0.061,P<0.05),气温(日平均、日最低、日最高气温)、日平均相对湿度与日ILI例数呈负相关(r=-0.189、-0.212、-0.165、-0.181,均P<0.01)。分布滞后非线性模型(DLNM)拟合结果显示各气象变量与日ILI发病例数都呈非线性关系,低温和高温的滞后期可达30d,温差较大时ILI发病的风险增加,相对湿度增加,滞后天数延长时,ILI发病的风险呈降低趋势,气压的变化对ILI发病的影响不明显。结论气象因素是影响西宁市ILI发病的重要因素,可以考虑纳入流感预警预测体系。
2018年05期 v.8 378-383页 [查看摘要][在线阅读][下载 2604K] - 刘立;李俊义;刘春云;李卫昆;李惠敏;祁燕伟;常丽仙;王辉;
目的观察索非布韦联合达拉他韦治疗基因3型初治慢性丙型肝炎患者的疗效和安全性。方法纳入2016年5月至2017年5月就诊于昆明市第三人民医院肝病科的基因3型初治慢性丙型肝炎患者158例,给予索非布韦联合达拉他韦抗病毒治疗12周,治疗后随访12周,观察治疗结束12周后持续性病毒学应答(SVR12)、生化学应答、肝纤维化改善和治疗期间的不良反应发生的情况。结果生化学指标中,治疗期间和随访12周的总胆红素(TB)、丙氨酸转氨酶(ALT)和天冬氨酸转氨酶(AST)均显著下降(F=12.37,P<0.001;F=105.4,P<0.001;F=205.68,P<0.001);而血小板(PLT)、血红蛋白(HB)和白细胞(WBC)变化不显著(F=2.016,P=0.134;F=1.743,P=0.187;F=1.203,P=0.237)。HCV RNA在治疗2周、4周和12周时分别有88.23%、94.77%和100.00%的患者低于检测下限。治疗12周和停药12周肝脏硬度值(LSM)均下降显著(t=10.061,P<0.001;t=9.555,P<0.001)。主要不良反应为乏力和头痛,无严重不良反应发生。结论对于基因3型初治慢性丙型肝炎患者,索非布韦联合达拉他韦方案可获得极高的SVR12率和生化学应答率,肝纤维化改善明显,且具有良好的安全性。
2018年05期 v.8 384-388页 [查看摘要][在线阅读][下载 312K] - 高媛;吴克;梁锦;李津;肖杨;
目的原核表达水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)糖蛋白E (gE)基因,并对其进行鉴定。方法构建大肠埃希菌重组载体pET28a-gE-his,利用IPTG诱导表达gE蛋白,经亲和层析纯化得到蛋白,用免疫印迹法验证目的蛋白的特异性。结果 pET28a-gE-his/BL21的IPTG诱导表达产物利用亲和层析纯化除去杂蛋白后,获得相对分子质量约为60×10~3的纯化蛋白,并且能与鼠抗gE糖蛋白单抗发生特异性结合,证明该蛋白为gE目的蛋白。结论成功利用大肠埃希菌表达重组VZV糖蛋白E,并利用亲和层析柱进行有效的纯化,从而为VZV糖蛋白E的应用研究打下了基础。
2018年05期 v.8 389-392页 [查看摘要][在线阅读][下载 640K] - 王吉;付瑞;李晓波;王淑菁;王莎莎;李威;秦骁;巩薇;岳秉飞;贺争鸣;
目的建立用于牛源性样本牛副流感病毒3型(BPIV3)实时荧光定量PCR (Q-PCR)快速检测方法。方法选择已发表的BPIV3 HN基因高度保守区域作为靶基因,设计合成引物和探针,建立BPIV3Q-PCR方法。并对方法的线性、特异性、敏感性、重复性、稳定性等进行方法学评价。同时用建立的Q-PCR方法检测105批次牛源性样本。结果建立的BPIV3Q-PCR方法线性范围为1×101拷贝/μl~1×108拷贝/μl;与牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛鼻气管炎病毒(BHV-1)、仙台病毒(SV)均无交叉反应;检测敏感度可以达到1.0×10~1拷贝/μl;3个不同浓度梯度标准品3次不同实验平均变异系数均小于5%。应用建立的方法检测105批次牛源性样本,BPIV3核酸阳性率为12.4%。结论建立的BPIV3QPCR检测方法线性关系良好,具有快速、特异、敏感及稳定的特点,可用于牛源性样本BPIV3的快速定量检测。
2018年05期 v.8 393-399页 [查看摘要][在线阅读][下载 1758K] - 李洁;陈丽娟;吕燕宁;杜轶威;卢桂兰;石伟先;崔淑娟;王全意;庞星火;
目的将黄热病毒实验诊断过程中的生物安全和生物安保风险降到最低。方法识别可疑黄热病病例样本在检测前、检测中及检测后的生物危害风险,依据风险分析和评估结果制定并采取风险防控措施。结果在检测前进行风险识别和分析,优化病原检测所需场所、仪器、材料及人员,确定操作规程及人员防护措施;对检测中样本开启、处理、分装、暂存及检测后废弃物处理、实验环境消毒、样本保藏及上送等各阶段开展风险识别及风险再评估,持续优化、完善防控措施。结论本研究为黄热病及其他蚊媒传播传染病的风险评估和应对措施制定提供了参考和依据。
2018年05期 v.8 400-405页 [查看摘要][在线阅读][下载 140K] - 何杨;吴晓宇;吉华贵;高燕;刘泉;周立晶;马小珍;童文彬;
目的了解四川省德阳市健康儿童的肠道病毒(enterovirus,EV)带毒状况,确定EV型别,并探讨其与手足口病病原谱的关系。方法 2016年5月19日在德阳市4家幼儿园采集健康儿童粪便标本进行EV核酸检测、病毒分离和核苷酸测序,根据进化树聚集确定EV型别。结果 203份标本中,EV核酸阳性81份。选取其中的60份EV核酸阳性标本(Ct≤33)进行部分VP2区直接测序和病毒分离,56份标本获取VP2区序列,29株病毒分离物获取VP1区全序列。VP1区核苷酸进化树显示,29株分离物分别与CV-A4、CV-A6、CV-A9、CV-A10、E11、E16和E30原型株聚集在一起;VP2区推导氨基酸进化树显示56份粪便标本也分别与相同的7种原型株聚集。标本VP2区定型结果和其对应的分离物VP1区定型结果一致。结论此次调查的德阳市健康儿童中EV阳性率为39.9%,检出7种EV型别。同一EV型别在1家幼儿园的多份标本中检出,提示局部存在密切接触传播。4种B组EV (CV-A9、E11、E16和E30)未在德阳市所有手足口病标本中检出过。VP1区分析是EV定型的最准确的方法;VP2区分析可初步确定EV组别,对部分EV也可正确定型,为下一步VP1区测序引物选择提供帮助。
2018年05期 v.8 406-410页 [查看摘要][在线阅读][下载 1953K]