- 程金芝;王宇;任刚;苏飞;唐小敏;
目的 分析贵州地区人类埃可病毒14型(Echovirus 14,ECHO 14)分离株的VP1基因特征，为ECHO 14的防控提供科学依据。方法 收集2001—2021年贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)监测系统中从AFP病例及健康儿童粪便标本中分离到的15株ECHO 14毒株并进行回顾性鉴定分析，采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1基因并对扩增产物测序，用MEGA7.0构建系统进化树并对氨基酸位点突变进行分析。结果 贵州地区15株ECHO 14分离株属于A、B和C基因亚型，其中A基因亚型占比达80.0%(12/15)。15株ECHO 14分离株之间的核苷酸一致性为81.8%～97.1%,氨基酸同源性为94.3%～99.7%,与原型株Tow (Rhode Island/54)株之间的核苷酸一致性为77.1%～79.4%,氨基酸同源性为95.1%～98.4%;与ECHO 14原型株Tow株比较分析，结果显示在VP1氨基酸序列上存在33个突变位点，其中8个位点已完全突变分别为N8D、K132T、G157D、L217M、V237I、M295L、H296Q和H298R。结论 2000—2021年贵州省AFP病例中分离的ECHO 14毒株属于A、B和C基因亚型，VP1区的氨基酸多位点变异，可能导致了多条传播链在贵州地区共循环，其中A基因亚型是2006年后贵州地区传播的优势亚型。
2022年06期 v.12 422-427页 [查看摘要][在线阅读][下载 997K] - 郝晓甜;李克坚;周诚;
目的 建立以“U/ml”为浓度单位的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)RNA检测试剂国家标准品，用于对HBV RNA检测试剂盒进行定量、准确性的质量控制和评价。方法 本研究从中国食品药品检定研究院库存的临床血样中筛选出2份高浓度HBV RNA标准品候选样品，经分装、冻干制备后确定HBV RNA检测试剂国家标准品。对标准品进行测序、赋值及协作标定后，考察其均匀性和稳定性。结果 确定HBV RNA检测试剂国家标准品为1支冻干的HBV RNA标准品候选样品，基因型为B型，浓度为2.1×10~8 U/ml。该标准品均匀性符合要求，4℃放置14 d、室温(25℃)放置3 d、37℃放置1 d以及反复冻融3次均不影响稳定性。结论 建立了第一代HBV RNA检测试剂国家标准品，浓度为2.1×10~8 U/ml,为相关试剂的质量控制和评价提供依据。
2022年06期 v.12 428-432页 [查看摘要][在线阅读][下载 874K] - 高帆;卞莲莲;么山山;毛群颖;梁争论;吴星;
目的 建立戊型肝炎疫苗抗原国家标准品，用于我国戊型肝炎疫苗质量控制。方法 选取一批戊型肝炎疫苗原液为标准品原料制备候选标准品(编号CS),进行均匀性和稳定性检测，并分发给3个实验室进行协作标定和适用性研究。结果 CS均匀性结果显示分装精度为0.7%;抗原含量均匀性CV值为6.8%;水分含量为0.4%。稳定性结果显示CS具有较好的加速稳定性和复溶稳定性。协作标定共获得16个有效数据，结果显示CS平均值为259 271 YU/支[95%CI:(259 271±5 768) YU/支],实验室内CV值为2.8%～6.9%,实验室间CV值为4.5%。依据3个实验室完成的协作标定结果，将CS赋值260 000 U/支。以CS为标准检测企业自制样品均显示较好的平行性和线性。结论 本研究建立了首个戊型肝炎疫苗抗原国家标准品(300051-202101),可用于我国戊型肝炎疫苗质量控制。
2022年06期 v.12 433-436页 [查看摘要][在线阅读][下载 881K] - 王俊杰;田春华;黄玉玲;曾亚莉;赖文红;
目的 深入了解四川省5个地市中老年男性艾滋病防控意识、高危性行为以及艾滋病感染情况，分析艾滋病感染的相关因素，为相关策略措施的制定提供参考。方法 选择在四川省广元市、遂宁市、宜宾市、自贡市、绵阳市城区商业街头、公园广场、娱乐场所、发廊、按摩店、旅社、出租屋等场所活动且年龄≥45岁的男性作为研究对象，通过社会组织或社区小组，运用场所招募、同伴推动、方便抽样等方式，调查收集社会人口学特征、性态度、高危性行为、艾滋病检测等情况，采集血液样本进行人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)检测。运用SPSS 19.0软件进行统计分析，采用单因素和多因素非条件logistic回归分析HIV感染相关因素。结果 共调查检测5个地市1 884名男性，HIV抗体阳性率为0.9%(17/1 884),45.3%(853/1 884)近1年内有商业性行为史，47.1%(887/1 884)近1年未接受过HIV抗体检测。HIV感染的多因素分析结果显示，近1年商业性行为中从未使用安全套者HIV感染风险是每次均使用者的16.289倍(OR=16.289,95%CI:3.318～79.970,P=0.001),近1年有临时性伴的性行为者HIV感染风险是没有临时性伴性行为者的3.200倍(OR=3.200, 95%CI:1.103～9.284,P=0.032)。结论 调查地区在商业街头、场所活动的45岁以上中老年男性存在不安全性行为，未进行HIV检测的比例较高，艾滋病传播风险较大，需要加强警惕性教育，提高防范意识，丰富业余生活，加强关怀和沟通，提高家庭和性责任意识，保持性伴忠贞，倡导安全的性行为，动员有高危性行为的人群及时进行艾滋病检测。
2022年06期 v.12 437-443页 [查看摘要][在线阅读][下载 820K] - 乔乔;吴涛;朱小娟;葛以跃;陈银;崔仑标;
目的 建立新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚基因组RNA(sgRNAs)荧光重组酶介导等温扩增(reverse-transcription recombinase-aided amplification, RT-RAA)检测方法。方法 根据SARS-CoV-2的5′-leader和7a、N基因序列设计特异性等温扩增引物和探针，在39℃等温条件下，30 min内对SARS-CoV-2的sgRNAs进行快速检测，并对该方法的灵敏度、特异度及与实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,real time PCR)法的一致性进行评价。结果 该方法检测限可达到20拷贝/μl,且与其他呼吸道病原体均无交叉反应，具有良好的灵敏度和特异度；与荧光定量PCR法相比，2种检测方法一致性较好(κ=0.762,P<0.001)。结论 本文建立的荧光RT-RAA法可用于SARS-CoV-2 sgRNAs的快速检测，对于临床样本感染性的快速诊断有重要意义。
2022年06期 v.12 444-447页 [查看摘要][在线阅读][下载 875K] - 李龙;郑敏娜;郭燕;宁铁林;龚卉;赵芳凝;于茂河;
目的 了解天津市青年男男同性性行为人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者治疗前耐药(pretrement drug resistance, PDR)特征，为临床治疗提供科学依据。方法 选取2015年1月—2018年12月天津市新诊断的120例青年男男同性性行为HIV感染者为研究对象，收集其人口学信息和治疗前的血浆样本，提取样本核酸后用巢式PCR法扩增HIV-1的pol基因。测序后成功获得105例pol基因序列样本，用于基因分型和治疗前耐药分析。结果 105份样本中，CRF01＿AE和CRF07＿BC亚型毒株占比最高，分别占53.33%(56/105)和27.62%(29/105),B亚型占6.67%(7/105),CRF55＿01B占3.81%(4/105),CRF68＿01B占0.95%(1/105),另外独特重组型(unique recombinant form, URF)占7.62%(8/105)。有4例重组模式相同，在pol基因2568～2592处发生了CRF01＿AE/C片段重组。共发现11例耐药，治疗前耐药率10.48%(11/105)。发现7种药物耐药，其中奈韦拉平(NVP)和依非韦仑(EFV)耐药率分别为8.57%(9/105)和6.67%(7/105)。结论 CRF01＿AE和CRF07＿BC亚型是天津市青年男男同性性行为HIV感染者的主要流行毒株，并且出现了一定数量的重组毒株，治疗前耐药率处于中度流行水平，毒株对NVP和EFV的耐药率已较高，应当引起临床机构的重视。
2022年06期 v.12 448-452页 [查看摘要][在线阅读][下载 891K] - 崔栋;肖娜;钟冠南;杨晓华;顾嘉颖;洪文腾;曾凡竹;
目的 分析2017—2020年深圳市盐田区H3N2亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因变异情况。方法 对盐田区2017—2020年分离的34株流感分离株HA基因进行扩增及序列测定，从GISAID流感数据库下载推荐疫苗株序列信息并利用MEGA X和NetNGlyc 1.0 Server在线分析软件对HA基因进行分析。结果 2017—2020年盐田区H3N2分离株位于3c.2a分支，2017年上半年分离株位于3C.2a2分支，7月份之后位于3C.2a1分支；2018—2020年位于3C.2a1b分支。2019—2020年流感分离株与当年疫苗株的核苷酸一致性与氨基酸同源性均低于其他年份。与同年疫苗株相比，2017—2018年分离株A区存在T135N(2/13)和R142K/G(13/13)变异；2018—2019年分离株A区存在T135K(10/10)和S137F(10/10)变异、B区存在F193S(8/10)和S198P(1/10)变异；2019—2020年分离株A区存在T135K(11/11)和S137F(11/11)变异、B区存在N158S(4/11)、N171K(11/11)和S198P(2/11)变异，E区存在G78S(11/11)变异。盐田区流感分离株受体结合位点前壁存在T131K(34/34),T135N/K(23/34)和S137F(21/34)变异。各年度分离株出现糖基化位点增加或消失现象。结论 盐田区H3N2流感病毒HA基因变异呈现多样性，应加强流感病毒监测。
2022年06期 v.12 453-457页 [查看摘要][在线阅读][下载 864K] - 曹冉冉;刘李;徐朝花;任敏;何吉兰;马小珍;
目的 探索四川地区环境污水中诺如病毒分子流行病学特征及环境监测的意义，同时对比2种高通量测序方法在环境监测中的应用，为病毒性病原环境监测提供技术参考。方法 2019年7—12月、2022年1—6月每月中旬在四川某污水处理厂进水口采集1 000 ml水样，经阴离子膜法浓缩富集后，提取核酸用实时荧光逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)检测诺如病毒，再用扩增子测序和宏病毒组测序方法分别对诺如病毒衣壳区基因序列进行分析。结果 2019年7—12月、2022年1—6月共采集12份环境污水标本，GⅠ、GⅡ型诺如病毒检出率均为100.0%(12/12)。水样利用扩增子测序注释到17种型别诺如病毒，包括GⅠ.1～GⅠ.7、GⅡ.1～GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.12、GⅡ.13、GⅡ.15、GⅡ.17,其中GⅠ.1、GⅡ.3、GⅡ.4相对丰度较高；2019年7—12月水样利用宏病毒组测序注释到4种型别诺如病毒和13种杯状病毒科其他属的病毒。结论 诺如病毒在四川地区环境污水中有很高的检出率，表明人群中有大量隐性感染者，且环境污水中检出多种在急性胃肠炎病例监测中少见或未见的诺如病毒型别，应继续加强环境监测，警惕诺如病毒急性胃肠炎的暴发流行。同时，在诺如病毒的环境监测中，扩增子测序较宏病毒组测序更为实用。
2022年06期 v.12 458-462页 [查看摘要][在线阅读][下载 793K]