党为人民谋健康的100年专栏 标准与指南

  • 登革热病媒生物应急监测与控制标准(WS/T 784—2021)

    <正>本标准按照GB/T 1.1—2020 《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。本标准起草单位:广东省疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所、北京市疾病预防控制中心、广东检验检疫技术中心、广东惠利民公共卫生健康研究院。本标准主要起草人:林立丰、刘起勇、赵彤言、曾晓芃、段金花、刘礼平、蔡松武、廖如燕、彭志强、李静、甘露。

    2021年06期 v.11 401-406页 [查看摘要][在线阅读][下载 718K]
  • 登革热病媒生物应急监测与控制标准(WS/T 784—2021)

    <正>本标准按照GB/T 1.1—2020 《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。本标准起草单位:广东省疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所、北京市疾病预防控制中心、广东检验检疫技术中心、广东惠利民公共卫生健康研究院。本标准主要起草人:林立丰、刘起勇、赵彤言、曾晓芃、段金花、刘礼平、蔡松武、廖如燕、彭志强、李静、甘露。

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党为人民谋健康的100年专栏 丁型肝炎

  • 丁型肝炎实验室诊断研究进展

    张振锋;庄辉;

    丁型肝炎是由丁型肝炎病毒和乙型肝炎病毒合并或重叠感染引起的急、慢性肝脏疾病,被认为是最严重的病毒性肝炎。不过长期以来,由于认识不足和治疗手段的缺乏,丁型肝炎的诊断进展缓慢。最近几年随着对相关研究的逐步深入,丁型肝炎逐渐受到重视,并且药物研发也取得了重大进展。这些都意味着对丁型肝炎的诊断的需求将大增,同时对其诊断方法也提出了更高的要求。本文就目前丁型肝炎的诊断方法进行简要综述,并对相关的问题进行讨论,为丁型肝炎的诊断提供参考。

    2021年06期 v.11 407-413页 [查看摘要][在线阅读][下载 996K]
  • 丁型肝炎实验室诊断研究进展

    张振锋;庄辉;

    丁型肝炎是由丁型肝炎病毒和乙型肝炎病毒合并或重叠感染引起的急、慢性肝脏疾病,被认为是最严重的病毒性肝炎。不过长期以来,由于认识不足和治疗手段的缺乏,丁型肝炎的诊断进展缓慢。最近几年随着对相关研究的逐步深入,丁型肝炎逐渐受到重视,并且药物研发也取得了重大进展。这些都意味着对丁型肝炎的诊断的需求将大增,同时对其诊断方法也提出了更高的要求。本文就目前丁型肝炎的诊断方法进行简要综述,并对相关的问题进行讨论,为丁型肝炎的诊断提供参考。

    2021年06期 v.11 407-413页 [查看摘要][在线阅读][下载 996K]
  • 丁型肝炎抗病毒新药研究进展

    刘玉梅;刘学恩;庄辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是缺陷病毒,需要在乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)的辅助下才能形成感染。据估计,约5%的HBV感染者合并感染HDV,表现为联合感染(co-infection)或重叠感染(superinfection) 2种形式。慢性丁型肝炎病情严重,疾病进展快,易发展为终末期肝病。干扰素单药或与核苷(酸)类似物(nucleoside/nucleotide analogs, NAs)联合治疗是目前临床治疗慢性丁型肝炎患者的常用方案,但存在持续病毒学应答率低,停药后易复发等问题。近年来,新型抗HDV药物的研发取得了一定进展,主要包括HBV/HDV进入抑制剂——Myrcludex B、法尼酰基转移酶抑制剂——Lonafarnib、HBsAg释放抑制剂—核酸多聚物以及免疫调节剂——Peg-IFNλ。本文就新型抗HDV药物的研究进展作简要综述。

    2021年06期 v.11 414-419页 [查看摘要][在线阅读][下载 895K]
  • 丁型肝炎抗病毒新药研究进展

    刘玉梅;刘学恩;庄辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是缺陷病毒,需要在乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)的辅助下才能形成感染。据估计,约5%的HBV感染者合并感染HDV,表现为联合感染(co-infection)或重叠感染(superinfection) 2种形式。慢性丁型肝炎病情严重,疾病进展快,易发展为终末期肝病。干扰素单药或与核苷(酸)类似物(nucleoside/nucleotide analogs, NAs)联合治疗是目前临床治疗慢性丁型肝炎患者的常用方案,但存在持续病毒学应答率低,停药后易复发等问题。近年来,新型抗HDV药物的研发取得了一定进展,主要包括HBV/HDV进入抑制剂——Myrcludex B、法尼酰基转移酶抑制剂——Lonafarnib、HBsAg释放抑制剂—核酸多聚物以及免疫调节剂——Peg-IFNλ。本文就新型抗HDV药物的研究进展作简要综述。

    2021年06期 v.11 414-419页 [查看摘要][在线阅读][下载 895K]
  • 丁型肝炎流行病学进展

    王麟;庄辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是一种缺陷病毒,需要乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)的辅助才能在人体建立感染。慢性HBV感染者重叠感染HDV可加速疾病进展,较单纯HBV感染者具有更高的发生肝癌风险。由于HDV感染被忽视,目前国内外仍缺乏准确的HDV感染流行率。近期,有关HDV感染流行率估计的研究增多,估计全球HDV感染人数为1 500万~2 000万,然而也有研究估计值为6 000万例。以上研究均提示,全球HDV感染流行率被低估,这就促使我们重新审视HDV的流行情况。因此,本文对HDV感染流行病学的最新进展作简要综述。

    2021年06期 v.11 420-426页 [查看摘要][在线阅读][下载 891K]
  • 丁型肝炎流行病学进展

    王麟;庄辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是一种缺陷病毒,需要乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)的辅助才能在人体建立感染。慢性HBV感染者重叠感染HDV可加速疾病进展,较单纯HBV感染者具有更高的发生肝癌风险。由于HDV感染被忽视,目前国内外仍缺乏准确的HDV感染流行率。近期,有关HDV感染流行率估计的研究增多,估计全球HDV感染人数为1 500万~2 000万,然而也有研究估计值为6 000万例。以上研究均提示,全球HDV感染流行率被低估,这就促使我们重新审视HDV的流行情况。因此,本文对HDV感染流行病学的最新进展作简要综述。

    2021年06期 v.11 420-426页 [查看摘要][在线阅读][下载 891K]
  • 慢性丁型肝炎抗病毒治疗策略的研究进展

    薛峰;魏来;

    慢性丁型肝炎是一种临床结局严重的慢性病毒性肝炎,目前聚乙二醇干扰素α是较为广泛使用的治疗方案,但总体疗效欠佳。近年来,针对多靶点的新药物处于研发中,包括欧盟药监系统有条件批准的bulevirtide。本文通过对抗丁型肝炎病毒药物研发的政策和方案的研究进展进行综述,以探讨有可能对今后临床实践有影响的抗丁型肝炎策略。

    2021年06期 v.11 427-430页 [查看摘要][在线阅读][下载 722K]
  • 慢性丁型肝炎抗病毒治疗策略的研究进展

    薛峰;魏来;

    慢性丁型肝炎是一种临床结局严重的慢性病毒性肝炎,目前聚乙二醇干扰素α是较为广泛使用的治疗方案,但总体疗效欠佳。近年来,针对多靶点的新药物处于研发中,包括欧盟药监系统有条件批准的bulevirtide。本文通过对抗丁型肝炎病毒药物研发的政策和方案的研究进展进行综述,以探讨有可能对今后临床实践有影响的抗丁型肝炎策略。

    2021年06期 v.11 427-430页 [查看摘要][在线阅读][下载 722K]
  • 丁型肝炎病毒感染动物模型的研究进展

    周忠敏;李文辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是目前已知感染人类的最小病毒。全球约有1 500万人感染HDV。HDV是一种缺陷型RNA病毒,其复制依赖于乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)。HBV合并HDV感染被认为是最严重的病毒性肝炎形式,呈现为急、慢性肝炎,病情容易进展为肝硬化和肝癌。在过去的几十年里,人们利用多种动物模型了解了很多HDV的感染机制,但对HDV感染和丁型肝炎病理机制的理解尚不完全,仍需建立新的、方便实用的动物模型以推动HDV基础研究和抗病毒药物的开发。本文对HDV感染动物模型的研究进展进行简要综述。

    2021年06期 v.11 431-437页 [查看摘要][在线阅读][下载 831K]
  • 丁型肝炎病毒感染动物模型的研究进展

    周忠敏;李文辉;

    丁型肝炎病毒(hepatitis D virus, HDV)是目前已知感染人类的最小病毒。全球约有1 500万人感染HDV。HDV是一种缺陷型RNA病毒,其复制依赖于乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)。HBV合并HDV感染被认为是最严重的病毒性肝炎形式,呈现为急、慢性肝炎,病情容易进展为肝硬化和肝癌。在过去的几十年里,人们利用多种动物模型了解了很多HDV的感染机制,但对HDV感染和丁型肝炎病理机制的理解尚不完全,仍需建立新的、方便实用的动物模型以推动HDV基础研究和抗病毒药物的开发。本文对HDV感染动物模型的研究进展进行简要综述。

    2021年06期 v.11 431-437页 [查看摘要][在线阅读][下载 831K]

论著

  • SARS-CoV-2 S蛋白和N蛋白特异性IgM和 IgG抗体动态变化研究

    赵令斋;伍妙梨;冯嘉敏;李凌华;洪文昕;丛峰;张复春;

    目的观察新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)患者核衣壳蛋白(nucleocapsid protein, N蛋白)和刺突蛋白(spike glycoprotein, S蛋白)的IgM和IgG抗体动态变化,了解机体对新型冠状病毒(severe gcute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)免疫反应情况,为抗体诊断试剂和疫苗的应用提供科学基础。方法应用N蛋白和S蛋白特异性IgM和IgG抗体免疫荧光层析法试剂盒检测2020年1月21日至2020年4月11日在广州医科大学附属市八医院住院的60例(其中48例轻症,12例重症)COVID-19患者发病9周内的290份系列血浆标本,操作步骤按照试剂盒说明书严格进行。结果 S蛋白抗体荧光定量值随病程呈明显的涨消过程(IgM:27.32~110.10 TU/ml; IgG:56.85~135.00 TU/ml), N蛋白抗体无明显波动,S蛋白抗体定量值在2~7周显著高于N蛋白;抗体阳性率在发病早期随病程逐渐上升,N蛋白IgM和IgG抗体从第1周的12.50%分别升至第4周的峰值51.72%和86.21%;S蛋白IgM和IgG抗体分别从第1周的25.00%和14.58%升至第4周的100.00%,之后开始下降;S蛋白IgM抗体阳性率在发病第2~8周高于N蛋白,IgG抗体阳性率在发病第2、3、4、6和7周高于N蛋白;重症患者第3周N蛋白IgG抗体阳性率(100.00%)高于轻症患者(59.52%)(χ~2=9.67,P=0.001 9);第2周S蛋白IgG抗体阳性率(80.00%)也高于轻症患者(46.58%)(χ~2=5.57,P=0.018 2)。结论 SARS-CoV-2 S蛋白比N蛋白诱导更高强度的抗体应答,抗体水平与病情严重程度有一定的相关性。

    2021年06期 v.11 438-443页 [查看摘要][在线阅读][下载 952K]
  • SARS-CoV-2 S蛋白和N蛋白特异性IgM和 IgG抗体动态变化研究

    赵令斋;伍妙梨;冯嘉敏;李凌华;洪文昕;丛峰;张复春;

    目的观察新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)患者核衣壳蛋白(nucleocapsid protein, N蛋白)和刺突蛋白(spike glycoprotein, S蛋白)的IgM和IgG抗体动态变化,了解机体对新型冠状病毒(severe gcute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)免疫反应情况,为抗体诊断试剂和疫苗的应用提供科学基础。方法应用N蛋白和S蛋白特异性IgM和IgG抗体免疫荧光层析法试剂盒检测2020年1月21日至2020年4月11日在广州医科大学附属市八医院住院的60例(其中48例轻症,12例重症)COVID-19患者发病9周内的290份系列血浆标本,操作步骤按照试剂盒说明书严格进行。结果 S蛋白抗体荧光定量值随病程呈明显的涨消过程(IgM:27.32~110.10 TU/ml; IgG:56.85~135.00 TU/ml), N蛋白抗体无明显波动,S蛋白抗体定量值在2~7周显著高于N蛋白;抗体阳性率在发病早期随病程逐渐上升,N蛋白IgM和IgG抗体从第1周的12.50%分别升至第4周的峰值51.72%和86.21%;S蛋白IgM和IgG抗体分别从第1周的25.00%和14.58%升至第4周的100.00%,之后开始下降;S蛋白IgM抗体阳性率在发病第2~8周高于N蛋白,IgG抗体阳性率在发病第2、3、4、6和7周高于N蛋白;重症患者第3周N蛋白IgG抗体阳性率(100.00%)高于轻症患者(59.52%)(χ~2=9.67,P=0.001 9);第2周S蛋白IgG抗体阳性率(80.00%)也高于轻症患者(46.58%)(χ~2=5.57,P=0.018 2)。结论 SARS-CoV-2 S蛋白比N蛋白诱导更高强度的抗体应答,抗体水平与病情严重程度有一定的相关性。

    2021年06期 v.11 438-443页 [查看摘要][在线阅读][下载 952K]
  • 2018—2019年昆明市发热呼吸道综合征患者人呼吸道腺病毒的初步基因分型及流行特征分析

    樊佩佩;周洁楠;伏晓庆;赵世文;

    目的了解2018—2019年云南省昆明市人呼吸道腺病毒(human adenovirus, HAdV)流行病学特征及其基因分型特征,为下一步防控工作提供科学依据。方法对云南省2018年1月1日—2019年12月31日昆明市6家哨点医院收集的650份发热呼吸道综合征监测病例标本进行实时逆转录-聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction, real-time RT-PCR)并筛选腺病毒阳性样本,使用Hep-2细胞对阳性标本进行病毒分离,用SPSS 20.0软件对数据进行统计学分析。对成功分离的腺病毒毒株进行hexon基因片段测序,使用MEGA5.0进行序列分析。结果 650份发热呼吸道综合征病例样本中共检测出50份腺病毒阳性,阳性检出率为7.69%(50/650)。经分离培养成功获得24株腺病毒毒株,分离率为48.00%(24/50)。其中1型占8.33%(2/24),2型占16.67%(4/24),3型占33.33%(8/24),5型占8.33%(2/24),7型占29.17%(7/24),未分型占4.17%(1/24)。男性腺病毒阳性检出率为8.27%(31/375),女性腺病毒阳性检出率为6.91%(19/275),不同性别阳性检出率差异无统计学意义(χ~2=0.412,P=0.554);鼻咽拭子腺病毒阳性检出率为7.13%(41/575),支气管肺泡灌洗液、痰液阳性检出率为12.00%(9/75),不同样本类型阳性检出率差异无统计学意义(χ~2=2.216,P=0.163);各年龄组阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=12.347,P=0.006),最高的为<5岁年龄组(10.26%,35/341);9种不同职业间阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=17.896,P=0.022),最高的职业类型是幼托儿童(13.10%,22/168);不同类型医院阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=20.467,P<0.01),非综合医院(13.28%,36/271)高于综合医院(3.69%,14/379);不同发病月份阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=7.872,P=0.049),夏季最高(13.19%,12/91),其次是秋季(9.66%,17/176)。结论 2018—2019年云南省昆明市腺病毒感染人群主要以5岁以下幼托儿童为主,随着年龄的上升,阳性检出率降低,检出高峰在夏季,非综合医院阳性检出率高于综合医院。

    2021年06期 v.11 444-450页 [查看摘要][在线阅读][下载 955K]
  • 2018—2019年昆明市发热呼吸道综合征患者人呼吸道腺病毒的初步基因分型及流行特征分析

    樊佩佩;周洁楠;伏晓庆;赵世文;

    目的了解2018—2019年云南省昆明市人呼吸道腺病毒(human adenovirus, HAdV)流行病学特征及其基因分型特征,为下一步防控工作提供科学依据。方法对云南省2018年1月1日—2019年12月31日昆明市6家哨点医院收集的650份发热呼吸道综合征监测病例标本进行实时逆转录-聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction, real-time RT-PCR)并筛选腺病毒阳性样本,使用Hep-2细胞对阳性标本进行病毒分离,用SPSS 20.0软件对数据进行统计学分析。对成功分离的腺病毒毒株进行hexon基因片段测序,使用MEGA5.0进行序列分析。结果 650份发热呼吸道综合征病例样本中共检测出50份腺病毒阳性,阳性检出率为7.69%(50/650)。经分离培养成功获得24株腺病毒毒株,分离率为48.00%(24/50)。其中1型占8.33%(2/24),2型占16.67%(4/24),3型占33.33%(8/24),5型占8.33%(2/24),7型占29.17%(7/24),未分型占4.17%(1/24)。男性腺病毒阳性检出率为8.27%(31/375),女性腺病毒阳性检出率为6.91%(19/275),不同性别阳性检出率差异无统计学意义(χ~2=0.412,P=0.554);鼻咽拭子腺病毒阳性检出率为7.13%(41/575),支气管肺泡灌洗液、痰液阳性检出率为12.00%(9/75),不同样本类型阳性检出率差异无统计学意义(χ~2=2.216,P=0.163);各年龄组阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=12.347,P=0.006),最高的为<5岁年龄组(10.26%,35/341);9种不同职业间阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=17.896,P=0.022),最高的职业类型是幼托儿童(13.10%,22/168);不同类型医院阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=20.467,P<0.01),非综合医院(13.28%,36/271)高于综合医院(3.69%,14/379);不同发病月份阳性检出率差异有统计学意义(χ~2=7.872,P=0.049),夏季最高(13.19%,12/91),其次是秋季(9.66%,17/176)。结论 2018—2019年云南省昆明市腺病毒感染人群主要以5岁以下幼托儿童为主,随着年龄的上升,阳性检出率降低,检出高峰在夏季,非综合医院阳性检出率高于综合医院。

    2021年06期 v.11 444-450页 [查看摘要][在线阅读][下载 955K]
  • 2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者病原检测与临床指标关联分析

    陈飞;王浩;黄京京;李侗曾;朱俊萍;

    目的分析2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者病原检测与临床指标间的关联。为提高手足口病不同病原感染的鉴别诊断和预后风险提供一定的科学依据。方法采用描述性流行病学方法分析2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者的一般情况、临床表现、实验室病原检测及临床指标。结果 2015—2019年北京佑安医院因手足口病住院的患者共计353例,肠道病毒核酸检测阳性的253例(71.67%),分为3组:肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EV-A71)阳性50例(19.76%),柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)阳性14例(5.53%),其他肠道病毒阳性189例(74.70%)。各组患者年龄均值从大到小依次为CV-A16组(3.88±6.35)岁,EV-A71组(2.84±1.94)岁和其他肠道病毒组(2.05±2.63)岁,3组间差异有统计学意义(χ~2=16.755,P<0.01)。3组间重症构成比(EV-A71组84.00%,其他肠道病毒组50.79%,CV-A16组42.86%),差异有统计学意义(χ~2=18.975,P<0.01)。3组中手部皮疹发生率(EV-A71组92.00%,CV-A16组:71.43%,其他肠道病毒组:77.25%)、臀部皮疹发生率(EV-A71组:66.00%,CV-A16组:42.86%,其他肠道病毒组:40.21%)以及神经系统症状的发生率差异有统计学意义(χ~2=5.998,P=0.05;χ~2=10.646,P=0.005;χ~2=7.351,P=0.025)。3组中C反应蛋白升高比例(EV-A71组:12.12%,CV-A16组:40.00%,其他肠道病毒组:70.23%),差异有统计学意义(χ~2=37.74,P<0.01)。结论 2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者的主要病原是其他肠道病毒。住院患者皮疹发生部位、神经系统症状、C反应蛋白等临床特征及指标在不同病原感染组间差异有统计学意义,提示其具有潜在临床诊断价值。

    2021年06期 v.11 451-454页 [查看摘要][在线阅读][下载 728K]
  • 2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者病原检测与临床指标关联分析

    陈飞;王浩;黄京京;李侗曾;朱俊萍;

    目的分析2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者病原检测与临床指标间的关联。为提高手足口病不同病原感染的鉴别诊断和预后风险提供一定的科学依据。方法采用描述性流行病学方法分析2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者的一般情况、临床表现、实验室病原检测及临床指标。结果 2015—2019年北京佑安医院因手足口病住院的患者共计353例,肠道病毒核酸检测阳性的253例(71.67%),分为3组:肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EV-A71)阳性50例(19.76%),柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)阳性14例(5.53%),其他肠道病毒阳性189例(74.70%)。各组患者年龄均值从大到小依次为CV-A16组(3.88±6.35)岁,EV-A71组(2.84±1.94)岁和其他肠道病毒组(2.05±2.63)岁,3组间差异有统计学意义(χ~2=16.755,P<0.01)。3组间重症构成比(EV-A71组84.00%,其他肠道病毒组50.79%,CV-A16组42.86%),差异有统计学意义(χ~2=18.975,P<0.01)。3组中手部皮疹发生率(EV-A71组92.00%,CV-A16组:71.43%,其他肠道病毒组:77.25%)、臀部皮疹发生率(EV-A71组:66.00%,CV-A16组:42.86%,其他肠道病毒组:40.21%)以及神经系统症状的发生率差异有统计学意义(χ~2=5.998,P=0.05;χ~2=10.646,P=0.005;χ~2=7.351,P=0.025)。3组中C反应蛋白升高比例(EV-A71组:12.12%,CV-A16组:40.00%,其他肠道病毒组:70.23%),差异有统计学意义(χ~2=37.74,P<0.01)。结论 2015—2019年北京佑安医院手足口病住院患者的主要病原是其他肠道病毒。住院患者皮疹发生部位、神经系统症状、C反应蛋白等临床特征及指标在不同病原感染组间差异有统计学意义,提示其具有潜在临床诊断价值。

    2021年06期 v.11 451-454页 [查看摘要][在线阅读][下载 728K]
  • 2297份临床病例标本SARS-CoV-2核酸检测情况及病毒分子特征分析

    陈静芳;徐明忠;张如胜;欧新华;黄政;姚栋;

    目的分析2020年1—2月长沙市疾病预防控制中心微生物实验室收集的2 297份新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)核酸检测基本情况和病毒的分子特征。方法对2020年1月19日—2020年2月29日送至长沙市疾病预防控制中心微生物实验室的新冠肺炎疑似病例咽拭子或呼吸道标本提取病毒RNA,采用实时逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction, real-time RT-PCR)进行SARS-CoV-2核酸检测;检测阳性标本用SARS-CoV-2全基因组捕获试剂盒进行SARS-CoV-2核酸富集,采用Illumina Miseq测序平台进行病毒全基因组测序,运用SPAdes-3.13.0软件进行序列拼接。从GISAID数据库中下载SARS-CoV-2参考序列进行全基因组遗传进化和抗原变异情况分析。结果共检测临床疑似病例标本2 297份,其中SARS-CoV-2核酸阳性标本215份;阳性病例中,男性110例,女性105例,男女性别比为1.05∶1;40~<60岁年龄组核酸检测阳性率最高(11.35%),6岁以下儿童检出阳性率最低(5.49%)。阳性病例检出高峰为第5周(2020年1月26日—2月1日),后逐渐减少,2020年2月25日后无本土新增病例出现。共获得5条SARS-CoV-2全基因组序列,与武汉参考病毒毒株相比核苷酸突变位点数为4~6个,同源性均在99.90%以上;除C8782T、T28144C 2个突变位点外,其他位点突变仅出现一次,呈现随机性;系统进化分析显示5条序列与同时期国内流行序列高度同源,分属于L/B和S/A 2个基因型。结论通过快速核酸检测和隔离等有效防控措施,长沙市本土SARS-CoV-2的流行在经历约2周的上升期后即开始下降,6周后再无新增确诊病例;全基因组序列分析发现2020年初长沙市流行的SARS-CoV-2与武汉首次报道的病毒高度同源,从输入到本土传播流行期间病毒未出现明显变异。

    2021年06期 v.11 455-459页 [查看摘要][在线阅读][下载 1072K]
  • 2297份临床病例标本SARS-CoV-2核酸检测情况及病毒分子特征分析

    陈静芳;徐明忠;张如胜;欧新华;黄政;姚栋;

    目的分析2020年1—2月长沙市疾病预防控制中心微生物实验室收集的2 297份新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)核酸检测基本情况和病毒的分子特征。方法对2020年1月19日—2020年2月29日送至长沙市疾病预防控制中心微生物实验室的新冠肺炎疑似病例咽拭子或呼吸道标本提取病毒RNA,采用实时逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcription polymerase chain reaction, real-time RT-PCR)进行SARS-CoV-2核酸检测;检测阳性标本用SARS-CoV-2全基因组捕获试剂盒进行SARS-CoV-2核酸富集,采用Illumina Miseq测序平台进行病毒全基因组测序,运用SPAdes-3.13.0软件进行序列拼接。从GISAID数据库中下载SARS-CoV-2参考序列进行全基因组遗传进化和抗原变异情况分析。结果共检测临床疑似病例标本2 297份,其中SARS-CoV-2核酸阳性标本215份;阳性病例中,男性110例,女性105例,男女性别比为1.05∶1;40~<60岁年龄组核酸检测阳性率最高(11.35%),6岁以下儿童检出阳性率最低(5.49%)。阳性病例检出高峰为第5周(2020年1月26日—2月1日),后逐渐减少,2020年2月25日后无本土新增病例出现。共获得5条SARS-CoV-2全基因组序列,与武汉参考病毒毒株相比核苷酸突变位点数为4~6个,同源性均在99.90%以上;除C8782T、T28144C 2个突变位点外,其他位点突变仅出现一次,呈现随机性;系统进化分析显示5条序列与同时期国内流行序列高度同源,分属于L/B和S/A 2个基因型。结论通过快速核酸检测和隔离等有效防控措施,长沙市本土SARS-CoV-2的流行在经历约2周的上升期后即开始下降,6周后再无新增确诊病例;全基因组序列分析发现2020年初长沙市流行的SARS-CoV-2与武汉首次报道的病毒高度同源,从输入到本土传播流行期间病毒未出现明显变异。

    2021年06期 v.11 455-459页 [查看摘要][在线阅读][下载 1072K]
  • 河南省洛阳市2016—2017年风疹病毒分子流行病学分析

    丰达星;王文慧;李光伟;田鹏;张广武;张延炀;

    目的分析河南省洛阳市2016—2017年风疹病例流行病学特征和风疹病毒分离株基因特征,为洛阳市风疹防控提供支持。方法搜集河南省洛阳市2016—2017年风疹病例流行病学信息,采用描述性流行病学的方法,分析其流行病学特征。采集病例咽拭子标本进行病毒分离,采用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因片段,测序后获得序列,使用Mega7.0.26软件进行进化树分析、同源性分析、核苷酸特征和氨基酸特征分析。结果河南省洛阳市2016—2017年共报告病例232例,年龄集中于10~<15岁组和15~<20岁年龄组,发病高峰月份集中于3—6月。共分离到风疹病毒56株,均为2B基因型,核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0~0.011和0~0.029。与2B基因参考株Rvi/Anqing.CHN/00/2B对比发现,氨基酸序列279位点异亮氨酸突变为缬氨酸,与Rvi/Beijing CHN/80/2A/Vac对比发现,氨基酸序列333位点丙氨酸突变为缬氨酸,这些突变与国内其他省份风疹分离株相同,E1蛋白基因糖基化位点以及抗原表位未发生变异。结论河南省洛阳市2016—2017年流行的风疹病毒2B基因型,核苷酸和氨基酸序列水平上高度保守,相关功能位点均未发生改变。

    2021年06期 v.11 460-466页 [查看摘要][在线阅读][下载 1205K]
  • 河南省洛阳市2016—2017年风疹病毒分子流行病学分析

    丰达星;王文慧;李光伟;田鹏;张广武;张延炀;

    目的分析河南省洛阳市2016—2017年风疹病例流行病学特征和风疹病毒分离株基因特征,为洛阳市风疹防控提供支持。方法搜集河南省洛阳市2016—2017年风疹病例流行病学信息,采用描述性流行病学的方法,分析其流行病学特征。采集病例咽拭子标本进行病毒分离,采用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因片段,测序后获得序列,使用Mega7.0.26软件进行进化树分析、同源性分析、核苷酸特征和氨基酸特征分析。结果河南省洛阳市2016—2017年共报告病例232例,年龄集中于10~<15岁组和15~<20岁年龄组,发病高峰月份集中于3—6月。共分离到风疹病毒56株,均为2B基因型,核苷酸和氨基酸遗传距离分别为0~0.011和0~0.029。与2B基因参考株Rvi/Anqing.CHN/00/2B对比发现,氨基酸序列279位点异亮氨酸突变为缬氨酸,与Rvi/Beijing CHN/80/2A/Vac对比发现,氨基酸序列333位点丙氨酸突变为缬氨酸,这些突变与国内其他省份风疹分离株相同,E1蛋白基因糖基化位点以及抗原表位未发生变异。结论河南省洛阳市2016—2017年流行的风疹病毒2B基因型,核苷酸和氨基酸序列水平上高度保守,相关功能位点均未发生改变。

    2021年06期 v.11 460-466页 [查看摘要][在线阅读][下载 1205K]
  • 天水市1997—2018年人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者生存分析

    郭强强;邸宏杰;李健;

    目的了解天水市人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)患者的生存时间及其影响因素。方法利用中国疾病预防控制信息系统1997—2018年天水市艾滋病病例资料,采用回顾性队列研究的方法,用寿命表法计算生存率,用Cox比例风险回归模型分析生存时间的影响因素。结果 1 016例HIV感染者/AIDS患者中,平均生存时间为152.69(95%CI:145.51~159.88)月,1、5、10年累积生存率分别为88.1%、78.9%、73.6%。Cox比例风险回归模型分析结果显示:在发生艾滋病相关死亡风险方面,未接受抗病毒治疗者是接受抗病毒治疗者的8.92倍;CD4~+T淋巴细胞计数<350个/μl者是CD4~+T淋巴细胞计数≥350个/μl者的8.73倍;未检测CD4~+T淋巴细胞计数者是CD4~+T淋巴细胞计数≥350个/μl者的16.99倍;高中及以上文化程度者是初中及以下文化程度者的0.53倍;异性传播是同性传播的1.62倍;26~<51岁和≥51岁年龄组死亡风险分别是<26岁年龄组的2.19倍和2.06倍。结论患者的年龄、文化程度、传播途径、发现途径、首次CD4~+T淋巴细胞检测结果、抗病毒治疗与否是影响其生存时间的危险因素,对HIV感染者/AIDS患者尽早进行检测和治疗可以延长其生存时间,及早进行CD4~+T淋巴细胞计数检测可以明确病程,促进患者尽快开展治疗,延长生存时间。

    2021年06期 v.11 467-471页 [查看摘要][在线阅读][下载 731K]
  • 天水市1997—2018年人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者生存分析

    郭强强;邸宏杰;李健;

    目的了解天水市人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)患者的生存时间及其影响因素。方法利用中国疾病预防控制信息系统1997—2018年天水市艾滋病病例资料,采用回顾性队列研究的方法,用寿命表法计算生存率,用Cox比例风险回归模型分析生存时间的影响因素。结果 1 016例HIV感染者/AIDS患者中,平均生存时间为152.69(95%CI:145.51~159.88)月,1、5、10年累积生存率分别为88.1%、78.9%、73.6%。Cox比例风险回归模型分析结果显示:在发生艾滋病相关死亡风险方面,未接受抗病毒治疗者是接受抗病毒治疗者的8.92倍;CD4~+T淋巴细胞计数<350个/μl者是CD4~+T淋巴细胞计数≥350个/μl者的8.73倍;未检测CD4~+T淋巴细胞计数者是CD4~+T淋巴细胞计数≥350个/μl者的16.99倍;高中及以上文化程度者是初中及以下文化程度者的0.53倍;异性传播是同性传播的1.62倍;26~<51岁和≥51岁年龄组死亡风险分别是<26岁年龄组的2.19倍和2.06倍。结论患者的年龄、文化程度、传播途径、发现途径、首次CD4~+T淋巴细胞检测结果、抗病毒治疗与否是影响其生存时间的危险因素,对HIV感染者/AIDS患者尽早进行检测和治疗可以延长其生存时间,及早进行CD4~+T淋巴细胞计数检测可以明确病程,促进患者尽快开展治疗,延长生存时间。

    2021年06期 v.11 467-471页 [查看摘要][在线阅读][下载 731K]
  • 2019—2021年北京市顺义区腺病毒引起的学校流感样病例暴发疫情流行特征分析

    胡广义;张文增;吴殚;

    目的分析2019—2021年北京市顺义区腺病毒引起的流感样病例暴发疫情,为学校腺病毒疫情防控工作提供参考。方法收集2019—2021年北京市顺义区学校流感样病例暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法分析3起腺病毒暴发疫情的流行特征,并与同期9起流感暴发疫情的临床症状和流行强度进行比较。结果 3起腺病毒暴发疫情共造成46人发病,总罹患率为1.80%(46/2 560)。3起腺病毒暴发疫情均发生在冬季,腺病毒感染病例除发热外,症状以咽痛(30.43%)为主。腺病毒病例中的咳嗽、流涕、乏力报告率低于流感病例,腺病毒病例年龄小于流感病例[(6.59±0.72)岁vs(7.35±2.52)岁,(t=3.834,P<0.01)]。腺病毒引起的暴发疫情中罹患班级占比(3.03%,3/99)、总罹患率(1.80%,46/2 560)均低于流感引起暴发疫情的罹患班级(9.94%,17/171)和总罹患率(2.90%,224/7 716),差异均有统计学意义(χ~2分别为4.37和9.19,P均<0.05)。结论腺病毒暴发呈现明显的季节性和班级聚集性,及时报告疫情和落实防控措施是遏制暴发疫情的关键。

    2021年06期 v.11 472-475页 [查看摘要][在线阅读][下载 717K]
  • 2019—2021年北京市顺义区腺病毒引起的学校流感样病例暴发疫情流行特征分析

    胡广义;张文增;吴殚;

    目的分析2019—2021年北京市顺义区腺病毒引起的流感样病例暴发疫情,为学校腺病毒疫情防控工作提供参考。方法收集2019—2021年北京市顺义区学校流感样病例暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法分析3起腺病毒暴发疫情的流行特征,并与同期9起流感暴发疫情的临床症状和流行强度进行比较。结果 3起腺病毒暴发疫情共造成46人发病,总罹患率为1.80%(46/2 560)。3起腺病毒暴发疫情均发生在冬季,腺病毒感染病例除发热外,症状以咽痛(30.43%)为主。腺病毒病例中的咳嗽、流涕、乏力报告率低于流感病例,腺病毒病例年龄小于流感病例[(6.59±0.72)岁vs(7.35±2.52)岁,(t=3.834,P<0.01)]。腺病毒引起的暴发疫情中罹患班级占比(3.03%,3/99)、总罹患率(1.80%,46/2 560)均低于流感引起暴发疫情的罹患班级(9.94%,17/171)和总罹患率(2.90%,224/7 716),差异均有统计学意义(χ~2分别为4.37和9.19,P均<0.05)。结论腺病毒暴发呈现明显的季节性和班级聚集性,及时报告疫情和落实防控措施是遏制暴发疫情的关键。

    2021年06期 v.11 472-475页 [查看摘要][在线阅读][下载 717K]
  • 东营市2010—2019年新报告人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者流行病学特征分析

    柴玉萍;王华丽;

    目的了解山东省东营市2010—2019年新报告人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)患者的流行病学特点,为进一步制定有效的防控策略提供依据。方法从"艾滋病综合防治信息系统"中,下载2010—2019年东营市HIV感染者/AIDS患者历史卡片库,采用描述性流行病学方法和χ~2检验对数据进行统计分析。结果东营市2010—2019年新报告HIV感染者/AIDS患者共470例,年报告数从2010年的14例增加到2019年的74例,其中HIV感染者所占的比例从2010年的50.0%(7/14)上升至2019年的75.7%(56/74),各年间差异有统计学意义(χ~2=25.808,P=0.002)。报告病例性别以男性为主,年龄以25~<50岁人群为主(67.9%,319/470)以初中及以下文化程度占比最多(44.3%,208/470),感染途径以性传播为主(98.7%,264/270),样本来源以医疗机构为主(42.6%,200/470)。异性传播占比由2010年的42.9%(6/14)上升至2019年的50.0%(37/74),各年间传播途径的分布差异有统计学意义(χ~2=30.193,P=0.036)。结论由于监测覆盖面的扩大和检测能力的提高,2010—2019年东营市新发现HIV感染者/AID患者呈逐年上升趋势,针对其流行特征,应该制定有针对性的干预措施。

    2021年06期 v.11 476-480页 [查看摘要][在线阅读][下载 765K]
  • 东营市2010—2019年新报告人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者流行病学特征分析

    柴玉萍;王华丽;

    目的了解山东省东营市2010—2019年新报告人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)感染者和艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome, AIDS)患者的流行病学特点,为进一步制定有效的防控策略提供依据。方法从"艾滋病综合防治信息系统"中,下载2010—2019年东营市HIV感染者/AIDS患者历史卡片库,采用描述性流行病学方法和χ~2检验对数据进行统计分析。结果东营市2010—2019年新报告HIV感染者/AIDS患者共470例,年报告数从2010年的14例增加到2019年的74例,其中HIV感染者所占的比例从2010年的50.0%(7/14)上升至2019年的75.7%(56/74),各年间差异有统计学意义(χ~2=25.808,P=0.002)。报告病例性别以男性为主,年龄以25~<50岁人群为主(67.9%,319/470)以初中及以下文化程度占比最多(44.3%,208/470),感染途径以性传播为主(98.7%,264/270),样本来源以医疗机构为主(42.6%,200/470)。异性传播占比由2010年的42.9%(6/14)上升至2019年的50.0%(37/74),各年间传播途径的分布差异有统计学意义(χ~2=30.193,P=0.036)。结论由于监测覆盖面的扩大和检测能力的提高,2010—2019年东营市新发现HIV感染者/AID患者呈逐年上升趋势,针对其流行特征,应该制定有针对性的干预措施。

    2021年06期 v.11 476-480页 [查看摘要][在线阅读][下载 765K]